Das Laguna San Ignacio Science Program (LSIESP) untersucht den ökologischen Zustand der Lagune und ihrer lebenden Meeresressourcen und stellt wissenschaftlich fundierte Informationen bereit, die für Fragen des Ressourcenmanagements und Bedenken hinsichtlich Entwicklung, Ökotourismus und Nachhaltigkeit des Lagunenökosystems relevant sind ein lebensfähiger Lebensraum für Meerestiere. Das Programm überwacht die Grauwale, die die Lagune jeden Winter besuchen, die Lagune und ihre Tierwelt als ein ganzes zusammenhängendes System. LSIESP fördert das soziale Bewusstsein, die Bildung und die Beteiligung der Gemeinschaft an der Erhaltung dieses Meeresschutzgebiets, fördert menschliche Aktivitäten und Alternativen, die im Gleichgewicht mit den natürlichen Komponenten der Region stehen und die Bedürfnisse der lokalen Gemeinschaft anerkennen.
Das Programm bietet Doktoranden die Möglichkeit, an angewandter Wildtier-Feldforschung teilzunehmen und Fähigkeiten zu erlernen, die ihnen in ihrer Karriere als Naturschutzwissenschaftler dienen werden. Gegebenenfalls bildet das Programm Partnerschaften und Kooperationen mit anderen Naturschutz- und Wildtiermanagementgruppen und -organisationen, die verschiedene Aspekte des Meeresschutzgebiets Laguna San Ignacio untersuchen. LSIESP-Forscher bieten Unterrichtspräsentationen an örtlichen Schulen und praktische Lernaktivitäten unter der Leitung von LSIESP-Forschern über die Tierwelt der Lagune und ihre Bedeutung als Küstenressource für das Meeresleben und die lokale Wirtschaft an. Dieses Bildungsprogramm stärkt das Bewusstsein der Schüler für die Notwendigkeit, die Laguna San Ignacio und ihre lebenden Meeresressourcen für zukünftige Generationen zu erhalten.
LSIESP-Forscher veranstalten jährliche Community-Workshops („Reunions“), um wissenschaftliche Erkenntnisse zu überprüfen und ein öffentliches Forum für den Informationsaustausch über die Lagune und menschliche Aktivitäten, die sie beeinflussen, bereitzustellen. Zu den Teilnehmern des Workshops gehören Fachexperten, Vertreter staatlicher Regulierungsbehörden, Ökotourismus-Anbieter, Anwohner, nichtstaatliche Umweltorganisationen, Schüler und Lehrer lokaler Schulen sowie die interessierte Öffentlichkeit. Die Ergebnisse des Programms werden über die Internet-Website (www.lsiecosystem.org), in Peer-Review-veröffentlichten Artikeln, in den lokalen Medien, auf wissenschaftlichen Fachtagungen und in lokalen Publikationen verbreitet.