A Laguna San Ignacio Tudományos Program (LSIESP) a lagúna és élő tengeri erőforrásai ökológiai állapotát vizsgálja, és olyan tudományos alapú információkat nyújt, amelyek relevánsak az erőforrás-gazdálkodással kapcsolatos kérdések és aggályok szempontjából a fejlesztéssel, az ökoturizmussal és a lagúna ökoszisztémájának fenntarthatóságával kapcsolatban. életképes élőhely a tengeri élővilág számára. A program a lagúnát minden télen meglátogató szürke bálnákat, a lagúnát és annak élővilágát egy teljes, egymással összefüggő rendszerként figyeli. Az LSIESP ösztönzi a társadalmi tudatosságot, az oktatást és a közösségi részvételt e védett tengeri terület megőrzésében, olyan emberi tevékenységeket és alternatívákat népszerűsít, amelyek egyensúlyban vannak a régió természetes összetevőivel, és felismerik a helyi közösség szükségleteit.
A program lehetőséget biztosít a végzős hallgatóknak, hogy részt vegyenek az alkalmazott vadon élő állatok terepkutatásában, és olyan készségeket sajátítsanak el, amelyek a vadvilágvédelmi tudósok pályafutását szolgálják. Adott esetben a program partnerséget és együttműködést alakít ki más természetvédelmi és vadgazdálkodási csoportokkal és szervezetekkel, amelyek a Laguna San Ignacio tengeri védett terület különböző aspektusait vizsgálják. Az LSIESP kutatói osztálytermi prezentációkat tartanak a helyi iskolákban, és a LSIESP kutatói által vezetett „kézben” tanulási tevékenységeket a lagúna vadvilágáról és annak jelentőségéről, mint a tengeri élővilág és a helyi gazdaság part menti erőforrásairól. Ez az oktatási ismeretterjesztő program erősíti a diákok tudatát a Laguna San Ignacio és élő tengeri erőforrásainak a jövő generációi számára történő megőrzésének szükségességével kapcsolatban.
Az LSIESP kutatói éves közösségi workshopokat („Reunions”) szerveznek, hogy áttekintsék a tudományos eredményeket, és nyilvános fórumot biztosítsanak a lagúnával és az azt érintő emberi tevékenységekkel kapcsolatos információk cseréjéhez. A workshop résztvevői között vannak szakterületi szakértők, állami szabályozó szervek képviselői, ökoturisztikai szolgáltatók, helyi lakosok, civil környezetvédelmi szervezetek, helyi iskolák diákjai és oktatói, valamint érdeklődő közönség. A program eredményeit az internetes weboldalon (www.lsiecosystem.org), lektorált cikkekben, a helyi médiában, szakmai tudományos üléseken és helyi kiadványokban terjesztik.