Навуковая праграма Laguna San Ignacio (LSIESP) даследуе экалагічны стан лагуны і яе жывых марскіх рэсурсаў, а таксама прадастаўляе навукова абгрунтаваную інфармацыю, якая мае дачыненне да пытанняў кіравання рэсурсамі і праблем развіцця, экалагічнага турызму і ўстойлівасці экасістэмы лагуны як жыццяздольнае асяроддзе пражывання для марскіх жывёл. Праграма адсочвае шэрых кітоў, якія наведваюць лагуну кожную зіму, лагуну і яе дзікую прыроду як цэласную ўзаемазвязаную сістэму. LSIESP заахвочвае грамадскую дасведчанасць, адукацыю і ўдзел грамадства ў захаванні гэтай марской ахоўнай тэрыторыі, спрыяе чалавечай дзейнасці і альтэрнатывам, якія знаходзяцца ў балансе з прыроднымі кампанентамі рэгіёну і якія прызнаюць патрэбы мясцовай супольнасці.
Праграма дае аспірантам магчымасць удзельнічаць у прыкладных палявых даследаваннях дзікай прыроды і навучыцца навыкам, якія паслужаць ім у кар'еры навукоўцаў па захаванні дзікай прыроды. Па меры неабходнасці праграма наладжвае партнёрства і супрацоўніцтва з іншымі групамі і арганізацыямі па захаванні і кіраванні дзікай прыродай, якія даследуюць розныя аспекты марской ахоўнай зоны Лагуна-Сан-Ігнасіа. Даследчыкі LSIESP праводзяць прэзентацыі ў класе ў мясцовых школах і практычныя навучальныя мерапрыемствы пад кіраўніцтвам даследчыкаў LSIESP па дзікай прыродзе лагуны і яе значэнні як прыбярэжнага рэсурсу для марскога жыцця і мясцовай эканомікі. Гэтая адукацыйная інфармацыйна-прапагандысцкая праграма ўмацоўвае дасведчанасць студэнтаў аб неабходнасці захавання лагуны Сан-Ігнасіа і яе жывых марскіх рэсурсаў для будучых пакаленняў.
Даследчыкі LSIESP праводзяць штогадовыя грамадскія семінары («Сустрэчы») для агляду навуковых высноў і забеспячэння грамадскага форуму для абмену інфармацыяй аб лагуне і дзейнасці чалавека, якая ўплывае на яе. Сярод удзельнікаў семінара - эксперты-прадметнікі, прадстаўнікі дзяржаўных кантралюючых органаў, аператары экалагічнага турызму, мясцовыя жыхары, няўрадавыя экалагічныя арганізацыі, навучэнцы і настаўнікі мясцовых школ, а таксама зацікаўленая грамадскасць. Вынікі праграмы распаўсюджваюцца праз Інтэрнэт-сайт (www.lsiecosystem.org), у рэцэнзаваных апублікаваных артыкулах, у мясцовых СМІ, на прафесійных навуковых сустрэчах і ў мясцовых выданнях.