Le programme scientifique Laguna San Ignacio (LSIESP) étudie l'état écologique de la lagune et de ses ressources marines vivantes, et fournit des informations scientifiques pertinentes pour les questions de gestion des ressources et les préoccupations concernant le développement, l'écotourisme et la durabilité de l'écosystème de la lagune. un habitat viable pour la faune marine. Le programme surveille les baleines grises qui visitent le lagon chaque hiver, le lagon et sa faune en tant que système interdépendant. Le LIESP encourage la sensibilisation sociale, l'éducation et la participation communautaire à la conservation de cette aire marine protégée, promeut les activités humaines et les alternatives qui sont en équilibre avec les composantes naturelles de la région et qui reconnaissent les besoins de la communauté locale.
Le programme offre aux étudiants diplômés la possibilité de participer à des recherches appliquées sur le terrain sur la faune et d'acquérir des compétences qui leur seront utiles dans leur carrière de scientifiques de la conservation de la faune. Le cas échéant, le programme forme des partenariats et des collaborations avec d'autres groupes et organisations de conservation et de gestion de la faune qui enquêtent sur divers aspects de l'aire marine protégée de Laguna San Ignacio. Les chercheurs du LIESP proposent des présentations en classe dans les écoles locales et des activités d'apprentissage « pratiques » dirigées par des chercheurs du LIESP sur la faune du lagon et son importance en tant que ressource côtière pour la vie marine et l'économie locale. Ce programme éducatif de sensibilisation renforce la prise de conscience des élèves sur la nécessité de conserver la Laguna San Ignacio et ses ressources marines vivantes pour les générations futures.
Les chercheurs du LSESP organisent des ateliers communautaires annuels (« réunions ») pour examiner les découvertes scientifiques et fournir un forum public pour l'échange d'informations sur le lagon et les activités humaines qui l'affectent. Les participants à l'atelier comprennent des experts en la matière, des représentants d'organismes de réglementation gouvernementaux, des opérateurs d'écotourisme, des résidents locaux, des organisations environnementales non gouvernementales, des étudiants et des instructeurs d'écoles locales et le public intéressé. Les résultats du programme sont diffusés via le site Internet (www.lsiecosystem.org), dans des articles publiés évalués par des pairs, dans les médias locaux, lors de réunions scientifiques professionnelles et dans des publications locales.